在使用sed进行文本处理的时候，有些情况下需要对不满足模式要求的行进行处理。sed是具有这个功能的。
首先，要明白sed的命令包含两个部分，一个部分是地址，一个部分是操作。例如，对于从UniProt下载的FASTA文件，如果想先把注释行变成只有AC的行，就需要这么做：
sed -re '/^>/ s/^>S+|(S+)|.*$/>1/g'
-re选项的含义是使用GNU正则表达式扩展，这样才可以在命令行里面使用例如S+这样的转义序列，如果不使用-re选项，那么就需要写成“S+”才能识别。
替换部分的含义是要开头是“>”然后是几个可打印字符，然后是两个“|”中间有若干可打印字符，然后是随便什么字符直到结束。我们需要的AC编号就在两个“|”中间。所以要把这里的S+用括号括起来，备用为反向引用。然后在替换部分使用“1”，来引用这个匹配部分。
那么，我们知道有20种标准的氨基酸，而BJOUXZ这6个字母都有可能出现在序列中，如果我们还想把序列里面的这些非标准符号都替换成“*”，那么怎么办呢。这就需要进行不匹配的行的操作，sed 的文档里面很明确的写道如下的内容：
“After the address (or address-range), and before the command, a ! may be inserted, which specifies that the command shall only be executed if the address (or address-range) does not match.”
所以，要想匹配那些序列行，并且去掉非标准符号，只要使用如下的命令就好了
sed -re '/^>/ ! s/[BJOUXZ]/*/g'